札幌別院は、札幌市の中心部に約9千坪の境内地を有します。明治期の北海道開拓・開教の拠点となり、現在も教化伝道の拠点となっています。創建の歴史は、1869（明治2）年、本山・東本願寺が明治新政府に出願し、翌年、当時弱冠19歳の現如(げんにょ)上人がその責任者となり、随員数百数十名とともに着手したことに始まります。境内に残る旧御堂は、1871（明治4）年、越後国光圓寺（新潟県新潟市）の古御堂を札幌別院本堂として移築したもので、今年で155年を迎えます。また、現在の本堂は本山と同じく伊藤平左衛門(いとうへいざえもん)氏の設計により1891（明治24）年に完成しました。札幌別院では、現如上人のご遺徳を偲び、毎月8日に開基現如上人御命日法要、27日・28日には宗祖親鸞聖人御命日法要が勤まり、広く一般にも開放しています。